Первый каменный храм монастыря поставлен на месте прежнего деревянного, освящённого еще преп. Ферапонтом. Церковь двухпрестольная с Никольским южным приделом. Построена в 1490 по типу московских храмов — основной объём кубического типа, крестово-купольный и четырёхстолпный.