Монашеское общежитие возникло в 1659 по замыслу темниковского дворянина Л. Евсюкова, пригласившего на свою землю старца Феодосия из Кадома. Благословенная грамота на построение первой деревянной церкви и образование обители получена в 1669. В 1753, в связи с крайней бедностью, Санаксарская пустынь была приписана к Саровской. Возобновляется с 1759 усердием иеромон. Феодора (Ушакова), благодаря ему избежала упразднения при введении штатов, в 1765 стала монастырём. Первый каменный храм сооружён в 1765-1774; размещённые по периметру колокольня, трапезный и келейные корпуса, а также ограда и проч. выстроены в основном в 1776-1790. Закрыт в 1929. Архитектурный ансамбль хорошо сохранился. Монастырь передан РПЦ в 1991, восстановлен.